La Franche-Comté possède 708 000 ha de forêts. Avec un taux de couverture de 44%, c'est la première région française, et la
seconde en surface gérée. Le Jura à lui seul compte 250 000 ha de forêts soit 50% de sa superficie, dont la moitié en forêt
publique domaniale ou communale. L'ONF de Franche-Comté a commercialisé 2 156 800 mètres-cubes de bois en 2004, dont
258 800 provenant des forêts domaniales et 1 898 000 des forêts de collectivités. Elle est composée à 70% de feuillus, les
résineux occupant l'étage montagnard.
La forêt jurassienne est multiforme : de l'immense forêt de Chaux dans la plaine, peuplée de grands cerfs, aux forêts d'altitude
comme la forêt du Massacre ou celle du Risoux, habitées par le lynx, en passant par la plus grande sapinière d'Europe, la forêt
de Joux. Son exploitation a été permanente, que ce soit pour alimenter la construction navale, les salines ou l'industrie métallugique
naissante du début du XIXe siècle. Partie intégrante du paysage jurassien, les forêts sont parfaitement signalisées et les promenades y
sont faciles, à pied l'été ou à ski l'hiver en montagne.
En France, le lynx a été éliminé entre les XVIIe et XIXe siècles. Réintroduit en 1983 dans les Vosges, il est revenu naturel-lement dans le
Jura et les Alpes, en provenance de Suisse. En 2006, l’effectif total est estimé à moins de deux cents animaux dans ces trois massifs
montagneux, la population la plus dynamique étant celle du Jura. Les films de Loïc Coat.